Angebote im Bereich Bioinformatik

Lehre

Vorlesung Bioinformatik (2+2)

• findet regelmäßig im Wintersemester statt, zuletzt: Wintersemester 2002/03
• teilweise mit eigenem Skript

Seminar im Hauptstudium

• Sommersemester 2001 (Blockseminar, Heinrich-Fabri-Institut, Blaubeuren)

Betreute Diplomarbeiten

• A.M. Böhm, Molekulare Sequenzanalyse und das Partial Digest Problem.
• S. Hirt, Algorithmische Methoden zum Vergleich biologischer Sequenzen (Gibbs Sampling).
• J. Hakenberg, Ein informationstheoretischer Ansatz zur Bestimmung von Strukturen in Proteindomänen.
  
  

• Vorschläge für weitere Themen

Forschung

Arbeitskreis Bioinformatik der Universität Ulm (Übersicht)

Rechnen mit Biomolekülen

• European Molecular Momputing Consortium (EMCC web page)
• Hubert Hug & Rainer Schuler, Strategies for the development of a peptide computer, Bioinformatics, 17:4 (2001) 364--368.
• Hubert Hug & Rainer Schuler, DNA-based parallel computation of simple arithmetic. Proceedings 7th International Meeting on DNA Based Computers, LNCS 2340, 2001, 321--328.
• Hubert Hug & Rainer Schuler, Implementation of a random walk method for solving 3-SAT on circular DNA molecules, Proceedings 8th International Meeting on DNA Based Computers DNA8, 2002, LNCS, to appear

Sequenz Analyse

• Hubert Hug & Rainer Schuler, A simple heuristic for locating cDNA sequences in genomic DNA, (2001) Manuscript.
• Jörg Hakenberg, Hubert Hug and Rainer Schuler, A statistical approach to analyse positional dependencies in protein domains, (2002) submitted
• Hubert Hug and Rainer Schuler, Measurement of the number of molecules of a single mRNA species in a complex mRNA preparation, Journal of Theoretical Biology, (2002) to appear.

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