University of Ulm , Faculty of Computer Science , Theoretical Computer Science Department

Hauptseminar (SS 2004):
Comparative Computational Genomics

Anküdigung und allgemeine Hinweise

Die Ankündigung dieser Lehrveranstaltung findet sich auf der elektronischen Pinnwand.
Einige allgemeine Hinweise zur Vortragsgestaltung finden sich in Ian Parberry: How to Present a Paper in Theoretical Computer Science: A Speaker's Guide for Students (PDF)

Vorträge

Zu den einzelnen Vortägen sind jeweils das Datum des Vortrages und die Ausarbeitung angegeben. Teilweise sind auch Quellen und Vortragsfolien verlinkt.

Biologische Grundlagen

Vortrag am 22.04.2004. Ausarbeitung (PDF) von Magnus Höld. Vortragsfolien (PPT) verfügbar. Literatur (PDF) ebenfalls online verfügbar. Betreut durch Jan Stallkamp.

Suffixbäume: Berechnung von exakten Repeats und MUMs

Vortrag am 29.04.2004 von Enno Ohlebusch. Weitere Informationen finden sich im Script Sequenzanalyse (PDF).

REPuter und Anwendung

Vortrag am 06.05.2004 von Thorsten Gräßle. Vortragsfolien (PPT) und Ausarbeitung (PDF) online verfügbar. Literaturhinweis: PDF und PDF. Betreut durch Enno Ohlebusch.

MUMmer und Anwendung

Vortrag am 13.05.2004 von Marco Wengenmayer. Vortragsfolien (PPT) und Ausarbeitung online verfügbar. Online verfügbare Literatur: PDF und PDF. Betreut durch Enno Ohlebusch.

Transformation Distance

Vortrag am 27.05.2004 von Christine Rauh, Literatur (PDF) online verfügbar. Ausarbeitung als PDF verfügbar. Betreut durch Mohamed Abouelhoda.

BLAST und GeneOrder

Vortrag am 03.06.2004 von Holger Wohlhüter. Ausarbeitung (PDF) verfügbar. Online verfügbare Literatur: Script Sequenzanalyse (PDF) und ein Paper zu GeneOrder (PDF). Betreut durch Mohamed Abouelhoda.

Genome Rearrangements

Vortrag am 17.06.2004 von Denise Dick. Vortragsfolien (PDF) und Ausarbeitung (PDF) online verfügbar. Betreut durch Jan Stallkamp

Sorting by Signed Reversals

Vortrag am 24.06.2004 von Martin Bader. Ausarbeitung (PDF) online verfügbar. Betreut durch Jan Stallkamp

Sorting by Transpositions

Vortrag am 01.07.2004 von Jochen Häberle. Literatur: als PDF. Vortragsfolien (PDF) und Ausarbeitung online verfügbar. Betreut durch Kathrin Hockel.

Jan Stallkamp - Send Message - last change: 10/12/2004